RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	DEDD	O75618	318 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CLDN14	O95500	239 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IFNA4	P05014	189 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	VDAC1	P21796	283 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LOXL3	P58215	753 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	BLOC1S1	P78537	153 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	NMS	Q5H8A3	153 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	F2RL2	O00254	374 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	FGF16	O43320	207 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ADAM20	O43506	726 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SPP1	P10451	314 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280		K7EPK0	472 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	MORN2	Q502X0	79 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SNAPIN	O95295	136 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CRYBA1	P05813	215 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	YPEL1	O60688	119 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	FCN3	O75636	299 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	NDUFB7	P17568	137 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	AVPI1	Q5T686	147 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CLN8	Q9UBY8	286 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RNF212B	A8MTL3	300 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	MSMO1	Q15800	293 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	UTF1	Q5T230	341 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	AGA	P20933	346 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	HKR1	P10072	659 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF134	P52741	427 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CORO2A	Q92828	525 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	NPBWR1	P48145	328 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280		Q3ZCU0	254 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	SEC11C	Q9BY50	192 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280		E5RGE8	158 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	COL8A2	P25067	703 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	PPOX	P50336	477 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DNM1-222	ENST00000636280	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.16	□□□□□ -0.3

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