RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SSX2Q16385 188 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PLA1AQ53H76 456 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TERB2Q8NHR7 220 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MALSU1Q96EH3 234 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 AJUBAQ96IF1 538 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 S1PR3Q99500 378 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GHITMQ9H3K2 345 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DPM3Q9P2X0 92 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.89□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 M0R1X1 148 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TNFSF12O43508 249 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A5O76082 557 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV2-14P01704 120 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 FBP1P09467 338 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ECI1P42126 302 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CCR6P51684 374 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF137PP52743 207 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DEFA1P59665 94 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DEFA3P59666 94 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ASAH1Q13510 395 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DRAM1Q8N682 238 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf30Q96GV9 206 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.88□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 OOSP1A8MZH6 123 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GPR31O00270 319 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TXNL1O43396 289 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PI3P19957 117 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GNRHRP30968 328 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 BTCP35070 178 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGDIBP52566 201 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 UCP3P55916 312 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SCGB2A2Q13296 93 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MOB3BQ86TA1 216 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 POC5Q8NA72 575 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GPHA2Q96T91 129 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 GAB2Q9UQC2 676 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 F8P00451 2351 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CUBNO60494 3623 aa6.87□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPI3 338 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 TIMM23O14925 209 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 PROP1O75360 226 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RLN1P04808 185 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CT45A6P0DMU7 189 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CT45A5P0DMU8 189 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 CT45A7P0DMV0 189 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RAB13P51153 203 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00205P59089 165 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 MSMO1Q15800 293 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD9Q7L273 389 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 OR8H3Q8N146 312 aa6.86□□□□□ -1.31
SGMS1-211ENST00000626236 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.86□□□□□ -1.31
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