RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SPEGQ15772 3267 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 A0A0G2JLM5 398 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 MPPED1O15442 326 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 RENP00797 406 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 IGHMP01871 453 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 GP1BBP13224 206 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ALOX5APP20292 161 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 GRPRP30550 384 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 PRDX2P32119 198 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ADAM8P78325 824 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 TTC28Q96AY4 2481 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 PSMB11A5LHX3 300 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 A6NIN4 97 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 IGLC2P0DOY2 106 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 IGLC3P0DOY3 106 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 NPY1RP25929 384 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SLC6A9P48067 706 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SPEM2Q0P670 501 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SIAH3Q8IW03 269 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 FGFRL1Q8N441 504 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 OR4X1Q8NH49 305 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ENY2Q9NPA8 101 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 U3KQA8 63 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 A0A0C4DFX4 3053 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 H7C1C5 153 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 NKX2-8O15522 239 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 HYPMO75409 117 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 IGHG3P01860 377 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 IL5P05113 134 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SDHBP21912 280 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 HRH1P35367 487 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 LCN6P62502 163 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 PRDX4Q13162 271 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 Q499Y3 187 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 BTNL8Q6UX41 500 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 Q6ZN92 141 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 A0A087WV48 116 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 XKRYO14609 159 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 NUDT14O95848 222 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 KIR2DS4P43632 304 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 OTOSQ8NHW6 89 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 THEM6Q8WUY1 208 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 BAALCQ8WXS3 180 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ACY3Q96HD9 319 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 KIAA1456Q9P272 454 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 B9D1Q9UPM9 204 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 V9GY05 133 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 CACNA1EQ15878 2313 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 A0A0B4J2A0 478 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 ZNF727A8MUV8 499 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 F8VVB4 439 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 F8VWA3 439 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 F2RL2O00254 374 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 FCN3O75636 299 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-244ENST00000602516 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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