RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PNN7	141 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	CA7	P43166	264 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP2K4	P45985	399 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	HES4	Q9HCC6	221 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	EMC3	Q9P0I2	261 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608		A8MWP6	167 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608		M0R036	132 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	DCTN3	O75935	186 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV3-19	P01714	112 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	HLA-DQB2	P05538	268 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	HAAO	P46952	286 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	FGF12	P61328	243 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	NAA20	P61599	178 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	PRDX4	Q13162	271 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	IHH	Q14623	411 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	STAC	Q99469	402 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	TBX5	Q99593	518 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	ABCG5	Q9H222	651 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	KIF15	Q9NS87	1388 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1B0GU33	70 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV1-17	P01599	117 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	ESD	P10768	282 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	OPRM1	P35372	400 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	CEBPG	P53567	150 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	IGFBP7	Q16270	282 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	OR8B2	Q96RD0	313 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	C16orf95	Q9H693	158 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ATP9B-223	ENST00000590608	COL1A2	P08123	1366 aa		2.59	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		2.59	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SOD1	P00441	154 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CCL1	P22362	96 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CRYBB3	P26998	211 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SERPINB10	P48595	397 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CTAG1A	P78358	180 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	AES	Q08117	197 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	FADD	Q13158	208 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	PYCR3	Q53H96	274 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SBSN	Q6UWP8	590 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2T4	Q8NH00	348 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2T27	Q8NH04	317 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4K13	Q8NH42	304 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFYVE9	O95405	1425 aa		2.58	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608		D6RAR5	112 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SYNGR2	O43760	224 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	ATP5H	O75947	161 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	TCRB	P04435	133 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	IFNA16	P05015	189 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	AKR1C2	P52895	323 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	STX5	Q13190	355 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	HTR4	Q13639	388 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM78B	Q5VT40	261 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OR11H1	Q8NG94	326 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	OPTN	Q96CV9	577 aa		2.57	□□□□□ -2
ATP9B-223	ENST00000590608	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		2.57	□□□□□ -2

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