RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	TXNL1	O43396	289 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	CD40LG	P29965	261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	BRS3	P32247	399 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	RAB13	P51153	203 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	LSAMP	Q13449	338 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TCF25-223	ENST00000568870	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SLC22A5	O76082	557 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PGAM2	P15259	253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CD24	P25063	80 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	IER3	P46695	156 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	LY6E	Q16553	131 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TNFSF12	O43508	249 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TCF21	O43680	179 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	IFNA2	P01563	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	HES1	Q14469	280 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PRRT1	Q99946	306 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CENPX	A8MT69	81 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	HILS1	P60008	231 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	AANAT	Q16613	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CFHR4	Q92496	578 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ESM1	Q9NQ30	184 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870		H7C2Y5	167 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	GPR31	O00270	319 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PROP1	O75360	226 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	UPK1B	O75841	260 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	APOA2	P02652	100 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	GNRHR	P30968	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	THBS3	P49746	956 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	DYNLT3	P51808	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	LINC00205	P59089	165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	KCTD9	Q7L273	389 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870		A0A0A6YYJ9	748 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	VENTX	O95231	258 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM11	P17152	192 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	PI3	P19957	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	CD1B	P29016	333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	S100G	P29377	79 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF25-223	ENST00000568870	ECI1	P42126	302 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms