RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567954.5

LYRM1-208, Transcript of LYR motif containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYRM1, Length 460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM1-208	ENST00000567954	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954		F5H768	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MPPED1	O15442	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SPINT2	O43291	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	GMNN	O75496	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SERPINA3	P01011	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CRYGC	P07315	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	RPA2	P15927	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CDKN1B	P46527	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MTPN	P58546	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954		Q8N814	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	FMO2	Q99518	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CRYGB	P07316	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	GZMM	P51124	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SELENOW	P63302	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	DGCR6	Q14129	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CRMP1	Q14194	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MICA	Q29983	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954		Q96M66	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954		S4R3C0	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954		K7EMT4	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	UBD	O15205	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SIVA1	O15304	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SPAG7	O75391	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	HBZ	P02008	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CPE	P16870	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	HOXA5	P20719	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CCL1	P22362	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ASAH1	Q13510	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LINC00473	A8K010	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ARPC2	O15144	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SNX3	O60493	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	MT-ND4	P03905	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	KIT	P10721	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC1A6	P48664	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	LIPE	Q05469	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	CGREF1	Q99674	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LYRM1-208	ENST00000567954	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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