RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567620.1

CHTF18-217, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-217ENST00000567620 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 SSX5O60225 188 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 AMY1AP04745 511 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 AMY2AP04746 511 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 PTHLHP12272 177 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF134P52741 427 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 GNMTQ14749 295 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 Q8N402 240 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 OR4F17Q8NGA8 305 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 OR4F4Q96R69 305 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 CCDC32Q9BV29 185 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 JPT1Q9UK76 154 aa11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CHTF18-217ENST00000567620 TXNL1O43396 289 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 RBBP9O75884 186 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ACTBP60709 375 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 HTD2P86397 168 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 DGCR2P98153 550 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 STEAP3Q658P3 488 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 Q6ZS49 121 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 C1QL4Q86Z23 238 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 OR52I2Q8NH67 350 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 PSMB11A5LHX3 300 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 HSPA12AO43301 675 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 YPEL1O60688 119 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 MOSP00540 346 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 OPN1MWP04001 364 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 FCGR3AP08637 254 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 CD1BP29016 333 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 RCVRNP35243 200 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 SLC35E3Q7Z769 313 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 HOGA1Q86XE5 327 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 YPEL2Q96QA6 119 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 Q9N2K0 584 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 IFT46Q9NQC8 304 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 FGF16O43320 207 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 GSTT2BP0CG30 244 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 PF4V1P10720 104 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 NAT1P18440 290 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 HMGN3Q15651 99 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 TRIM63Q969Q1 353 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.87□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 KCNAB3O43448 404 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 LANCL1O43813 399 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 CD83Q01151 205 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 EBI3Q14213 229 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 KIR2DS1Q14954 304 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 BAK1Q16611 211 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 TRIQKQ629K1 86 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF329Q86UD4 541 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 BORCS5Q969J3 196 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 KLK11Q9UBX7 282 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 TRDCB7Z8K6 153 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 J3QRK9 145 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ST8SIA5O15466 376 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 WIPF1O43516 503 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 UPK1BO75841 260 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 IL7P13232 177 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 TBPP20226 339 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ZBTB25P24278 435 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 CEACAM6P40199 344 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 OR3A3P47888 321 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF137PP52743 207 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 AP3S2P59780 193 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 SLC35B1P78383 322 aa11.85□□□□□ -0.51
CHTF18-217ENST00000567620 Q6ZPA2 131 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms