RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 OPRL1P41146 370 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 PPP5CP53041 499 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ST3GAL3Q11203 375 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 GAGE1Q13065 139 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 GAGE4Q13068 117 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 MED21Q13503 144 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 PLGLAQ15195 96 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 CYP51A1Q16850 503 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SHFQ7M4L6 423 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 COMMD2Q86X83 199 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ZIM3Q96PE6 472 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SORT1Q99523 831 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 RNF150Q9ULK6 438 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SAR1BQ9Y6B6 198 aa3.07□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GW64 132 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PRQ8 180 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 FUOMA2VDF0 154 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SH2D1BO14796 132 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 OGG1O15527 345 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 NDUFA3O95167 84 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 CA2P00918 260 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV3-23P01764 117 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF44P15621 663 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 FUT3P21217 361 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 IFNA8P32881 189 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ATP1B3P54709 279 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 MTPNP58546 118 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF146Q15072 292 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF691Q5VV52 312 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 NPBQ8NG41 125 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 IFT81Q8WYA0 676 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 THRSPQ92748 146 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 FAM46BQ96A09 425 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 PRRC1Q96M27 445 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 HARBI1Q96MB7 349 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 TEAD3Q99594 435 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 PKIBQ9C010 78 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 GPR84Q9NQS5 396 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 COA4Q9NYJ1 87 aa3.06□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 EVPLLA8MZ36 301 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 RIPK2O43353 540 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 APOC1P02654 83 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 SHBGP04278 402 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 MIFP14174 115 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 AADACP22760 399 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 NPY1RP25929 384 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 IL3RAP26951 378 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 FMO3P31513 532 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 TRAM2Q15035 370 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 Q6P435 159 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00311Q8N616 119 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 OR6N2Q8NGY6 317 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 OR1L1Q8NH94 360 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 TPD52L3Q96J77 140 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 CHST5Q9GZS9 411 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 S4R3C0 116 aa3.05□□□□□ -1.92
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms