RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	S1PR3	Q99500	378 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MMP28	Q9H239	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	BET1	O15155	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	LANCL1	O43813	399 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	PMP2	P02689	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RRAS	P10301	218 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CD99	P14209	185 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	NFYB	P25208	207 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	HTR1D	P28221	377 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	SLC6A1	P30531	599 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	DYNLT3	P51808	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	TAS2R31	P59538	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RND3	P61587	244 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CATR1	Q13166	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	GPR31	O00270	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	NDUFB6	O95139	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ARG1	P05089	322 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	FGF2	P09038	288 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ANXA3	P12429	323 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RPA2	P15927	270 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	OMG	P23515	440 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MC5R	P33032	325 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	GPR12	P47775	334 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RAB13	P51153	203 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	CADM3	Q8N126	398 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	POC5	Q8NA72	575 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CHP1-208	ENST00000560965	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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