RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 OR5H1A6NKK0 313 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 ZG16O60844 167 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TNFRSF9Q07011 255 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 ACSM6Q6P461 480 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 Q8IYB0 196 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 MIOXQ9UGB7 285 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 CACNA1HO95180 2353 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 RAC2P15153 192 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 HBG1P69891 147 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 HBG2P69892 147 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 FOXF2Q12947 444 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 GALMQ96C23 342 aa14.85□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 M0R296 226 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TNFSF10P50591 281 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 ST8SIA5O15466 376 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TFF3Q07654 80 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF645Q8N7E2 425 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 LINC00473A8K010 186 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 BMP5P22003 454 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 TGFBR3Q03167 851 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 EDDM3AQ14507 147 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 C1QL4Q86Z23 238 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 MGAQ8IWI9 3026 aa14.83□□□□□ -0.03
XRCC3-218ENST00000557439 A0A087WWC5 75 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BKO60814 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BJP06899 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BOP23527 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BBP33778 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BDP58876 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BCP62807 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 LHX4Q969G2 390 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.83□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 COL10A1Q03692 680 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 WDR82Q6UXN9 313 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 TTC28Q96AY4 2481 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF737O75373 536 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 WNT2P09544 360 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 Q3ZCU0 254 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 WDR31Q8NA23 367 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HES4Q9HCC6 221 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 PSG11Q9UQ72 335 aa14.82□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 NECAP1Q8NC96 275 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 LRRC30A6NM36 301 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HOXA5P20719 270 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 CD81P60033 236 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 Q6ZT83 130 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.81□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 CECR9P0C854 216 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 S100A12P80511 92 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 SSX9Q7RTT3 188 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 FRZBQ92765 325 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 NINJ1Q92982 152 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 GGACTQ9BVM4 153 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.8□□□□□ -0.04
XRCC3-218ENST00000557439 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms