RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550077.1

AC055716.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC055716.1, Length 495 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC055716.1-201ENST00000550077 ING3Q9NXR8 418 aa6.7□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 KLK11Q9UBX7 282 aa6.7□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ZNF221Q9UK13 617 aa6.7□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.7□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 A0A1W2PPE3 182 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 I3L521 148 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SIRPB1O00241 398 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 RBBP9O75884 186 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 NDUFB6O95139 128 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 DHFRP00374 187 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FAM106CPP0CH98 169 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 PTHLHP12272 177 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 CD34P28906 385 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 PRSS3P35030 304 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 GPR12P47775 334 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SLURP1P55000 103 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 P2RX3P56373 397 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 AESQ08117 197 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 IL24Q13007 206 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 UBE2V2Q15819 145 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 HAGHQ16775 308 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 COMMD1Q8N668 190 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ZNF596Q8TC21 504 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FAM46BQ96A09 425 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SPSB1Q96BD6 273 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 NABP2Q9BQ15 211 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.69□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 A0A0A6YYD4 124 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 TOR1AO14656 332 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FGF16O43320 207 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SAP30O75446 220 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 CA11O75493 328 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 IL5P05113 134 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 TBPP20226 339 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 BCL3P20749 454 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 NFYBP25208 207 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 PSMB8P28062 276 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 RCVRNP35243 200 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 CCR6P51684 374 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ZP1P60852 638 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FOXE3Q13461 319 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 KISS1Q15726 138 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 AWAT2Q6E213 333 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 OR10K2Q6IF99 312 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ASCL4Q6XD76 172 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 Q8N9W7 124 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 TOMM40LQ969M1 308 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 COQ2Q96H96 371 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 TM2D1Q9BX74 207 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 PKIBQ9C010 78 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.68□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 KMT2AQ03164 3969 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 A0A087X0M5 115 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 A0A1B0GX30 115 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 G3V318 75 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 J3QR06 171 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 AP4M1O00189 453 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 MFNGO00587 321 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 MGST3O14880 152 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 IGHG4P01861 327 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 ELANEP08246 267 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 AKAIN1P0CW23 69 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.67□□□□□ -1.34
AC055716.1-201ENST00000550077 CGB3P0DN86 165 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms