RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542133.5

NPIPB4-215, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-215	ENST00000542133	MTCP1	P56278	107 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	PLP2	Q04941	152 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	GAGE5	Q13069	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	GAGE6	Q13070	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF404	Q494X3	552 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	BTNL8	Q6UX41	500 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	NPIPB3	Q92617	1050 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM54	Q969K7	222 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TOMM40L	Q969M1	308 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TAAR8	Q969N4	342 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SMIM19	Q96E16	107 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CCDC126	Q96EE4	140 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	PELI1	Q96FA3	418 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	MRAP2	Q96G30	205 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	DHDH	Q9UQ10	334 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	AP4S1	Q9Y587	144 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF726	A6NNF4	738 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	GYG2	O15488	501 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR2T1	O43869	369 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRAF2	O60831	178 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CA11	O75493	328 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SNAPC5	O75971	98 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TYMS	P04818	313 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	DBH	P09172	617 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	RAB3B	P20337	219 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CBL	P22681	906 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ETV6	P41212	452 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	PIGP	P57054	158 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ERVFRD-1	P60508	538 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	PPP1CB	P62140	327 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CD47	Q08722	323 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRR27	Q6MZM9	219 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133		Q6ZR03	302 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SHF	Q7M4L6	423 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	MUC7	Q8TAX7	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	MOB3A	Q96BX8	217 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CXorf58	Q96LI9	332 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	KCTD7	Q96MP8	289 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	MBOAT4	Q96T53	435 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	C5orf49	A4QMS7	147 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CHEK1	O14757	476 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ENTPD6	O75354	484 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	FSTL3	O95633	263 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	OPN1SW	P03999	348 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CD28	P10747	220 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TBP	P20226	339 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	KIR2DS4	P43632	304 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	FUT6	P51993	359 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	CDH12	P55289	794 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBE2V1	Q13404	147 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	IL13RA2	Q14627	380 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	AWAT2	Q6E213	333 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF613	Q6PF04	617 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPIPB4-215	ENST00000542133	SERPINA11	Q86U17	422 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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