RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 NPPCP23582 126 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-204ENST00000538708 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.08□□□□□ -1.12
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PTPRB-204ENST00000538708 HTN3P15516 51 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 FSTP19883 344 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
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