RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF286AQ9HBT8 521 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB9BQ9NP90 201 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNIP1Q9NZI2 227 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTFP1Q9UDX5 166 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF462Q96JM2 2506 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0A6YYD4 124 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEIS3P1A6NDR6 274 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX46H3BTG2 121 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MFNGO00587 321 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYRM1O43325 122 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2H2O95918 312 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RD3LP0DJH9 198 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAX6P26367 422 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRDX2P32119 198 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ID1P41134 155 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR12P47775 334 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM50BP56557 158 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAS2R46P59540 309 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEF2DQ14814 521 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C5orf47Q569G3 176 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNLZQ5SXM8 178 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYG2Q86SG7 212 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR4K15Q8NH41 348 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEH1LQ96EE3 360 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM56Q96MV1 263 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCL19Q99731 98 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPAGT1Q9H3H5 408 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HES4Q9HCC6 221 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCUBQ9NWR8 336 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COPZ2Q9P299 210 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLK11Q9UBX7 282 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AK3Q9UIJ7 227 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.69□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEIOCA2RUB1 952 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F8VVB4 439 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F8VWA3 439 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM178BH3BS89 294 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSPB6O14558 160 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WNT9BO14905 357 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAMP3O60896 148 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC22A5O76082 557 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTTG1O95997 202 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LHBP01229 141 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DANCRP0C864 163 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSG2P11465 335 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTHLHP12272 177 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBPP20226 339 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC6A1P30531 599 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIR2DS4P43632 304 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL10A1Q03692 680 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIR2DS1Q14954 304 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CARTPTQ16568 116 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STEAP1BQ6NZ63 245 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6P435 159 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM185AQ8NFB2 350 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BEST4Q8NFU0 473 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCGB3A2Q96PL1 93 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms