RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 A0A1W2PRV1 198 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 E5RGE8 158 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DVL1O14640 695 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TAAR5O14804 337 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RAB29O14966 203 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 ST8SIA3O43173 380 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.423e-22■■□□□ 12.2
SEC31A-241ENST00000515749 RP2O75695 350 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 CLDN1O95832 211 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV2-70P01814 119 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RBP4P02753 201 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TFF1P04155 84 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 CXCL2P19875 107 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 COL8A2P25067 703 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 GPR12P47775 334 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TLE4Q04727 773 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RAB32Q13637 225 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 GNMTQ14749 295 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 NMSQ5H8A3 153 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 GPR157Q5UAW9 335 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TEX261Q6UWH6 196 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 SLC51BQ86UW2 128 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF843Q8N446 348 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 AQP10Q96PS8 301 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 ARL6Q9H0F7 186 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 CHODLQ9H9P2 273 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 COA4Q9NYJ1 87 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 MBD2Q9UBB5 411 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 PSG11Q9UQ72 335 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 NSG2Q9Y328 171 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 U3KQ87 197 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.2□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 A0A087X0M5 115 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 A0A1B0GX30 115 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 MPTX1A8MV57 137 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TNFSF12O43508 249 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DEDDO75618 318 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 LY86O95711 162 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 SOD3P08294 240 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 EFNA4P52798 201 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 ID3Q02535 119 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF585BQ52M93 769 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00311Q8N616 119 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 OR51H1Q8NH63 302 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 UBALD1Q8TB05 177 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DCUN1D4Q92564 292 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TNFRSF14Q92956 283 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 OR8B2Q96RD0 313 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 S1PR3Q99500 378 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 PRR13Q9NZ81 148 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RNF150Q9ULK6 438 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.19□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 A0A1B0GW55 424 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 RNF222A6NCQ9 220 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 C17orf98A8MV24 154 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 H0YIZ8 118 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 C19orf84I3L1E1 186 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 K7EPK0 472 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 OVOL3O00110 214 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 BCL2L11O43521 198 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 TSC22D2O75157 780 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 PITX3O75364 302 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 MED6O75586 246 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 HPRT1P00492 218 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.18□□□□□ -1.42
SEC31A-241ENST00000515749 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms