RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.91□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.91□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.91□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.91□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 RNF7Q9UBF6 113 aa6.91□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.91□□□□□ -1.3
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NEK1-208ENST00000512193 A0A1W2PPB8 328 aa6.9□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.9□□□□□ -1.3
NEK1-208ENST00000512193 A0A1W2PRS3 328 aa6.9□□□□□ -1.3
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NEK1-208ENST00000512193 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.9□□□□□ -1.3
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NEK1-208ENST00000512193 M0R296 226 aa6.9□□□□□ -1.3
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NEK1-208ENST00000512193 IER3P46695 156 aa6.9□□□□□ -1.3
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NEK1-208ENST00000512193 HARBI1Q96MB7 349 aa6.9□□□□□ -1.3
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NEK1-208ENST00000512193 TMEM210A6NLX4 147 aa6.9□□□□□ -1.3
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NEK1-208ENST00000512193 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.9□□□□□ -1.31
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NEK1-208ENST00000512193 ZG16O60844 167 aa6.9□□□□□ -1.31
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NEK1-208ENST00000512193 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.89□□□□□ -1.31
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NEK1-208ENST00000512193 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.319e-10■■■■■ 36.7
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NEK1-208ENST00000512193 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.89□□□□□ -1.31
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NEK1-208ENST00000512193 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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NEK1-208ENST00000512193 KCNMB1Q16558 191 aa6.89□□□□□ -1.31
NEK1-208ENST00000512193 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.89□□□□□ -1.31
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