RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506401.6

ITGA3-207, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 1,817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-207ENST00000506401 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C18orf12Q96KH6 178 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 A8MXK9 166 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 M0R1W7 72 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 M0R1X1 148 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 LINC00311Q8N616 119 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 OR9G1Q8NH87 305 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 IL22RA2Q969J5 263 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SEC22AQ96IW7 307 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 S1PR3Q99500 378 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SMLR1H3BR10 107 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 J3QR06 171 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 FOXH1O75593 365 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ARF6P62330 175 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 NOXA1Q86UR1 476 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.61□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TOR1AO14656 332 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 PROP1O75360 226 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 PRRX1P54821 245 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 LCN2P80188 198 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF596Q8TC21 504 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C2orf50Q96LR7 162 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 PTPN13Q12923 2485 aa14.6□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 RPA2P15927 270 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SLC35G3Q8N808 338 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TNFRSF14Q92956 283 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 NMES1Q9C002 83 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 COMMD9Q9P000 198 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 LINC00473A8K010 186 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 OR10C1Q96KK4 312 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 HYLS1Q96M11 299 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.59□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 SLC25A16P16260 332 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 LPAR6P43657 344 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 THBS3P49746 956 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 FGL1Q08830 312 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF585BQ52M93 769 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 Q8N7P7 452 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 FBN2P35556 2912 aa14.58□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 MPTX1A8MV57 137 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 IL3RAP26951 378 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 KIR2DS2P43631 304 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 GZMKP49863 264 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM186Q96B77 213 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 KPTNQ9Y664 436 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 ATG12O94817 140 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 VDAC1P21796 283 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 PRTN3P24158 256 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 PAX2Q02962 417 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 Q5BKY6 102 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.57□□□□□ -0.08
ITGA3-207ENST00000506401 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms