RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1D-33P01593 117 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1-33P01594 117 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 INPP1P49441 399 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 ACTBL2Q562R1 376 aa10.77□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 TCF19Q9Y242 345 aa10.77□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 CHST1O43916 411 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 PEX14O75381 377 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC22A5O76082 557 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 MOSP00540 346 aa10.73□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 CT45A7P0DMV0 189 aa10.73□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf152Q5JTZ5 239 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 GIMAP1Q8WWP7 306 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 CCL28Q9NRJ3 127 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 MCUBQ9NWR8 336 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.73□□□□□ -0.69
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