RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 CEACAM6P40199 344 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TPPP2P59282 170 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 NDPQ00604 133 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 OR10K2Q6IF99 312 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 LFNGQ8NES3 379 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 RHOVQ96L33 236 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 STUB1Q9UNE7 303 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.27□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 LDLRAD4O15165 306 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 NAPSAO96009 420 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TRGV3P03979 118 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 CPEP16870 476 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 PSG5Q15238 335 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 PHYHIPQ92561 330 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 CYYR1Q96J86 154 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 CITED4Q96RK1 184 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF221Q9UK13 617 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.26□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0G2JLM5 398 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 CNIH1O95406 144 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 BPNT1O95861 308 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 SRMP19623 302 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ZP3P21754 424 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 AHSA2Q719I0 299 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 AGMATQ9BSE5 352 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TM2D1Q9BX74 207 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 GAB2Q9UQC2 676 aa9.25□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 EBAG9O00559 213 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 SPDEFO95238 335 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 CA2P00918 260 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV1-51P01701 117 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 APOA2P02652 100 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 INSL4Q14641 139 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 FXYD3Q14802 87 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TATDN3Q17R31 274 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N1Y9 231 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 PTX4Q96A99 478 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ISOC1Q96CN7 298 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 NICN1Q9BSH3 213 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TMED9Q9BVK6 235 aa9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 A8MZ25 164 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 H0Y980 276 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 H3BUA1 57 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 UNC119Q13432 240 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.23□□□□□ -0.93
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CNOT4-211ENST00000498534 POC5Q8NA72 575 aa9.23□□□□□ -0.93
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CNOT4-211ENST00000498534 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 MND1Q9BWT6 205 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 AK3Q9UIJ7 227 aa9.23□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 LCE6AA0A183 80 aa9.22□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.22□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 SOCS1O15524 211 aa9.22□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A17O43808 307 aa9.22□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV1-16P04430 117 aa9.22□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 IFNA6P05013 189 aa9.22□□□□□ -0.93
CNOT4-211ENST00000498534 GNAO1P09471 354 aa9.22□□□□□ -0.93
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