RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	SOX15	O60248	233 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	RAMP3	O60896	148 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZBTB25	P24278	435 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CRHBP	P24387	322 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CX3CL1	P78423	397 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF616	Q08AN1	781 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MGLL	Q99685	303 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PROP1	O75360	226 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	LY86	O95711	162 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CD3G	P09693	182 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	OR8U8	P0C7N1	319 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	SLURP1	P55000	103 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10A3	P58181	314 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	DCUN1D4	Q92564	292 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		V9GY05	133 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	CA2	P00918	260 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MC5R	P33032	325 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	RUNX1	Q01196	453 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PSG5	Q15238	335 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	SSX1	Q16384	188 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ASCL2	Q99929	193 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A075B6Q4	140 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A087WW49	117 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		M0R1X1	148 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	OVOL1	O14753	267 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	LFNG	Q8NES3	379 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	PTX4	Q96A99	478 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A0B4J203	849 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	BET1	O15155	118 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RBBP9	O75884	186 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC01619	G3V211	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	FABP7	O15540	132 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A17	O43808	307 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SAP30	O75446	220 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	APOA2	P02652	100 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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