RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL20	P78556	96 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZRG5	221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	RELN	P78509	3460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	HCFC1	P51610	2035 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730		A6NLC8	198 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730		A6NNC1	897 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	RAMP3	O60896	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	FCN3	O75636	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CST7	O76096	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ATG12	O94817	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	PLAU	P00749	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SELL	P14151	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	VDAC1	P21796	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	OMG	P23515	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXC12	P31275	282 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CD80	P33681	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SSTR5	P35346	364 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CEACAM6	P40199	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CD200	P41217	278 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CAV2	P51636	162 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	DYNLT3	P51808	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFA5	Q01523	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CLINT1	Q14677	625 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	MIDN	Q504T8	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8IYB0	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	NRGN	Q92686	78 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	FLNC	Q14315	2725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	DYSF	O75923	2080 aa		4.81	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GU03	582 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00473	A8K010	186 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BP45	60 aa		4.8	□□□□□ -1.64
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC31A2	O15432	143 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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