RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	FAM25A	B3EWG3	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FAM25C	B3EWG5	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FAM25G	B3EWG6	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	CTDSP2	O14595	271 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	TOR1A	O14656	332 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	RGS5	O15539	181 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	MNDA	P41218	407 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	PRRX1	P54821	245 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	GNG2	P59768	71 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	UTF1	Q5T230	341 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	COMMD1	Q8N668	190 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	GALM	Q96C23	342 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FCGR3A	P08637	254 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	SCT	P09683	121 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	DTYMK	P23919	212 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	HTD2	P86397	168 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF596	Q8TC21	504 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	PSG11	Q9UQ72	335 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344		J3QR06	171 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	SSX5	O60225	188 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	JTB	O76095	146 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	IGLV1-47	P01700	117 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	PTHLH	P12272	177 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	CEACAM3	P40198	252 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	TAS2R20	P59543	309 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	HLA-DRB3	P79483	266 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	MORN2	Q502X0	79 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	MCFD2	Q8NI22	146 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	YPEL1	O60688	119 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	GSTT2	P0CG29	244 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	GSTT2B	P0CG30	244 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FAM106CP	P0CH98	169 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	GNG10	P50151	68 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344		Q3ZCU0	254 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	TEX38	Q6PEX7	206 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344		Q6ZS49	121 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	STPG2	Q8N412	459 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	HERC2	O95714	4834 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PPE3	182 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344		A6NHS1	94 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FABP7	O15540	132 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	RGS11	O94810	467 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	PRSS3	P35030	304 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	HES1	Q14469	280 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	STEAP3	Q658P3	488 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM3-208	ENST00000489344	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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