RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 TCL1AP56279 114 aa11.47□□□□□ -0.57
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HDLBP-241ENST00000487169 GP6Q9HCN6 339 aa11.47□□□□□ -0.57
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HDLBP-241ENST00000487169 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-241ENST00000487169 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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HDLBP-241ENST00000487169 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.46□□□□□ -0.58
HDLBP-241ENST00000487169 HTN1P15515 57 aa11.46□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 PARP11Q9NR21 331 aa11.44□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.44□□□□□ -0.58
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