RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486911.2

C9orf85-206, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene C9orf85, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-206ENST00000486911 GNB4Q9HAV0 340 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 SIRPB1O00241 398 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 ZNHIT1O43257 154 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 TOMM40O96008 361 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 BCL3P20749 454 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 AQP7P3A6NL99 342 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 ESDP10768 282 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 KIR2DS4P43632 304 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 KIR2DS1Q14954 304 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 Q6ZSR3 168 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.71□□□□□ -1.01
C9orf85-206ENST00000486911 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 C3orf80F5H4A9 247 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 ZNF253O75346 499 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CA3P07451 260 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 NTF3P20783 257 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TSPOP30536 169 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.71□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 SLC25A6P12236 298 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 OR1L1Q8NH94 360 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 OCC1Q8TAD7 63 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 UCN2Q96RP3 112 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CLN8Q9UBY8 286 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 PDE6DO43924 150 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 LCN12Q6JVE5 192 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 OR1L3Q8NH93 324 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 RDH5Q92781 318 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 LRRC61Q9BV99 259 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 IL36GQ9NZH8 169 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 DPRXA6NFQ7 191 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TMPRSS2O15393 492 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 SMPD2O60906 423 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 WDR1O75083 606 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CTXN2P0C2S0 81 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 C3orf79P0CE67 100 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TNFSF4P23510 183 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TIMP3P35625 211 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 PCSK4Q6UW60 755 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 PARM1Q6UWI2 310 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CLDN23Q96B33 292 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.7□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 A0A1W2PN81 502 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CRYGSP22914 178 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TNFRSF4P43489 277 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 SLC35B1P78383 322 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 HTD2P86397 168 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 RCHY1Q96PM5 261 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 CD46P15529 392 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TGFBR3Q03167 851 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 SPINK9Q5DT21 86 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TMEM42Q69YG0 159 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 UHRF2Q96PU4 802 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 GTF3C1Q12789 2109 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 ZNF32P17041 273 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 GFRA1P56159 465 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 EDDM3BP56851 147 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 Q0VG73 95 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf85-206ENST00000486911 C10orf128Q5T292 105 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms