RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DPF1	Q92782	380 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404		H0YJW9	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404		M0R1X1	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	IGF1	P05019	195 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TFAP2A	P05549	437 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ELANE	P08246	267 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CT45A6	P0DMU7	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CT45A5	P0DMU8	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CT45A7	P0DMV0	189 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CD36	P16671	472 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	SDC2	P34741	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RAB25	P57735	213 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CBX3	Q13185	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CENPO	Q9BU64	300 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF580	Q9UK33	172 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RRH	O14718	337 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	NDUFA3	O95167	84 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TNFAIP8	O95379	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DIRAS3	O95661	229 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	GSTT2	P0CG29	244 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	GSTT2B	P0CG30	244 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	GNG2	P59768	71 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	IGSF11	Q5DX21	431 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	NPB	Q8NG41	125 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RITA1	Q96K30	269 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	FBXL15	Q9H469	300 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM235	A6NFC5	223 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	SPDEF	O95238	335 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	IGHG4	P01861	327 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DTYMK	P23919	212 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	MYCNOS	P40205	109 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	THBS3	P49746	956 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CDNF	Q49AH0	187 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TG	P01266	2768 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404		A0A087WXM4	84 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	SCAND1	P57086	179 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	PITPNA	Q00169	270 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CFHR3	Q02985	330 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DEFB136	Q30KP8	78 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	HACD4	Q5VWC8	232 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF5	Q99942	180 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79

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