RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF150Q9ULK6 438 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 STUB1Q9UNE7 303 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC42Q9Y546 428 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 A8MZ25 164 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 ARSBP15848 533 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 RNF5Q99942 180 aa7.18□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 PMS2P11Q13670 270 aa7.17□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 TM2D1Q9BX74 207 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.17□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BUA1 57 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 CD1AP06126 327 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 CEACAM6P40199 344 aa7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DRB3P79483 266 aa7.16□□□□□ -1.26
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SMARCE1-210ENST00000481231 DEFA5Q01523 94 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5T1Q8NG75 326 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.16□□□□□ -1.26
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