RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 ERVFRD-1P60508 538 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 SLC25A28Q96A46 364 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 RNF24Q9Y225 148 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 SERF2P84101 59 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.58□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 CA11O75493 328 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FOLR2P14207 255 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 TMEM11P17152 192 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 Q6ZSR3 168 aa6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.58□□□□□ -1.36
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