RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RPEQ96AT9 228 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MOB3AQ96BX8 217 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 C5orf30Q96GV9 206 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR2D2Q9H210 308 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 GHITMQ9H3K2 345 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 GAB2Q9UQC2 676 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR5H14A6NHG9 310 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 AMY2AP04746 511 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IFNA6P05013 189 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 REG1BP48304 166 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DYNLT3P51808 116 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 AP3S2P59780 193 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 HERV-K104P61576 105 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TSPAN5P62079 268 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PLA1AQ53H76 456 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 Q6YL49 198 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM17Q86X19 198 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR8H3Q8N146 312 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CFHR4Q92496 578 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RHOVQ96L33 236 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 NABP2Q9BQ15 211 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF221Q9UK13 617 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.25□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 VGLL3A8MV65 326 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DISC1C4P0D8 188 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 M0R1X1 148 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TIMM23O14925 209 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TXNL1O43396 289 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 UPK1BO75841 260 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PF4P02776 101 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 INPP1P49441 399 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MSMO1Q15800 293 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 AANATQ16613 207 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DRAM1Q8N682 238 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PIFOQ8TCI5 191 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 S1PR3Q99500 378 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 H3BUX3 64 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PLA2G10O15496 165 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SLC22A5O76082 557 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV4-59P01825 116 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CT45A6P0DMU7 189 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CT45A5P0DMU8 189 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CT45A7P0DMV0 189 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 GNRHRP30968 328 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IER3P46695 156 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RAB13P51153 203 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 UCP3P55916 312 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IFITM3Q01628 133 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FBLN7Q53RD9 439 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MOB3BQ86TA1 216 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF383Q8NA42 475 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TERB2Q8NHR7 220 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TSC22D3Q99576 134 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SSX3Q99909 188 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PRRT1Q99946 306 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ESM1Q9NQ30 184 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MCUBQ9NWR8 336 aa8.23□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MTORP42345 2549 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CD24P25063 80 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms