RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 AK3Q9UIJ7 227 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB29O14966 203 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LDLRAD4O15165 306 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGS11O94810 467 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 BPNT1O95861 308 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1-16P04430 117 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCTP09683 121 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPNP16150 400 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPHARQ15513 63 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACSM6Q6P461 480 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF383Q8NA42 475 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTX4Q96A99 478 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MND1Q9BWT6 205 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q9N2K0 584 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1456Q9P272 454 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC42Q9Y546 428 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.5□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHISA3A0PJX4 238 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01619G3V211 115 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC17A2O00624 439 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CA2P00918 260 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV2-23P01705 113 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-11P01762 117 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYGBP07316 175 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDN12P56749 244 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSG5Q15238 335 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 P2RY14Q15391 338 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM65Q6PI78 240 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF429Q86V71 674 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8N1Y9 231 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LFNGQ8NES3 379 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SETD6Q8TBK2 473 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRG4Q8WWG1 115 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARPC1AQ92747 370 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHOVQ96L33 236 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PECRQ9BY49 303 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUSP21Q9H596 190 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSF4Q9ULV5 492 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.49□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTGES3LE9PB15 166 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAP30O75446 220 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBBP9O75884 186 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD3GP09693 182 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 GP9P14770 177 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEACAM6P40199 344 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 VEGFCP49767 419 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 AQP4P55087 323 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPBGQ13641 420 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED22Q15528 200 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTBL2Q562R1 376 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM203Q969S6 136 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MS4A10Q96PG2 267 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCHY1Q96PM5 261 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLCC1Q96S66 551 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF150Q9ULK6 438 aa6.48□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.47□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 C3orf84H3BNL1 204 aa6.47□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 H7C2Y5 167 aa6.47□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A17O43808 307 aa6.47□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPDEFO95238 335 aa6.47□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LY86O95711 162 aa6.47□□□□□ -1.37
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