RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 FCER2P06734 321 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 INPP1P49441 399 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-11P60412 298 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 HES1Q14469 280 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 BAK1Q16611 211 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 HACD4Q5VWC8 232 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 TRIQKQ629K1 86 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 OR52I2Q8NH67 350 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 CCDC32Q9BV29 185 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 U3KQK5 164 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 HSD17B6O14756 317 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SSX5O60225 188 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 LPLP06858 475 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IL7P13232 177 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IL3RAP26951 378 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZS46 218 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MOB3BQ86TA1 216 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 OR56B4Q8NH76 319 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GPX8Q8TED1 209 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IFT46Q9NQC8 304 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 PSMB11A5LHX3 300 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 OOSP1A8MZH6 123 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SULT1C2O00338 296 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SLC31A2O15432 143 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 LANCL1O43813 399 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 UPK1BO75841 260 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 RBBP9O75884 186 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MYCNOSP40205 109 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SLC35B1P78383 322 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 HNF4GQ14541 408 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GNMTQ14749 295 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 COMMD1Q8N668 190 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 DRAM1Q8N682 238 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 TRIM63Q969Q1 353 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 ZFP57Q9NU63 452 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 KLK11Q9UBX7 282 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 NUDT19A8MXV4 375 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 LY6LH3BQJ8 138 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 FCGR3AP08637 254 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 FAM106CPP0CH98 169 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 TMEM11P17152 192 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 RCVRNP35243 200 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 CBX5P45973 191 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 THBS3P49746 956 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 RAB7AP51149 207 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 ACTBP60709 375 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GAPTQ8N292 157 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GALMQ96C23 342 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPI3 338 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1D-33P01593 117 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1-33P01594 117 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 IFITM3Q01628 133 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 HMGN3Q15651 99 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 STEAP3Q658P3 488 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-210ENST00000442481 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms