RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 MPPED1O15442 326 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP5P22003 454 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 CBLN1P23435 193 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMB3P49720 205 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ATOH7Q8N100 152 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N976 141 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM45BQ96B21 275 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 HCRTR1O43613 425 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-34P06331 123 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSEP14091 401 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 EGR1P18146 543 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 GNRHRP30968 328 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 BLKP51451 505 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 MFAP4P55083 255 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 MZT1Q08AG7 82 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 BMFQ96LC9 184 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TM2D1Q9BX74 207 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 CLN8Q9UBY8 286 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO7AQ13402 2215 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM250H0YL14 139 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGPTL7O43827 346 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP23AO75900 390 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT2P09544 360 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PGCP20142 388 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPOP30536 169 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ID3Q02535 119 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 MORN2Q502X0 79 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR146Q96CH1 333 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6C1Q96RD1 312 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A22Q9H936 323 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF22Q9HCT0 170 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6C6A6NF89 314 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR1O75083 606 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 GP1BBP13224 206 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 LHX2P50458 406 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 NXPH1P58417 271 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TLE3Q04726 772 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2M3Q8NG83 312 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB10Q8WXI3 467 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 VDAC3Q9Y277 283 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JNG1 304 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PP55 124 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRS3 328 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 LIPT2A6NK58 231 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 E9PLN8 166 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SIVA1O15304 175 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAI2O43623 268 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1D-33P01593 117 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-33P01594 117 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QTNF9P0C862 333 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 FAHP16930 419 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNOP22674 350 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CDAP32320 146 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1D4P47884 311 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NPBWR2P48146 333 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 BIDP55957 195 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SRPXP78539 464 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL16Q0P5N6 197 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZP4Q12836 540 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DS5Q14953 304 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CARD17Q5XLA6 110 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 HARBI1Q96MB7 349 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KNL1Q8NG31 2342 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH23Q9H251 3354 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHMP01871 453 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms