RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 MALSU1Q96EH3 234 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 UCP3P55916 312 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 LPCAT3Q6P1A2 487 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 POC5Q8NA72 575 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 C5orf30Q96GV9 206 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 AJUBAQ96IF1 538 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 NF1P21359 2839 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 M0R1X1 148 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 IGLV2-14P01704 120 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 GNRHRP30968 328 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 PLA1AQ53H76 456 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 GAB2Q9UQC2 676 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 GPR31O00270 319 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 FBP1P09467 338 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SRD5A1P18405 259 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 RSRP1Q9BUV0 290 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 OOSP1A8MZH6 123 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 TXNL1O43396 289 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 TNFSF12O43508 249 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 PROP1O75360 226 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 PI3P19957 117 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 MSMO1Q15800 293 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 PHLDA2Q53GA4 152 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 CMTM1Q8IZ96 169 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB34Q8NCN2 500 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ENKURQ8TC29 256 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 NDUFB6O95139 128 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 SLC6A1P30531 599 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGDIBP52566 201 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 SCGB2A2Q13296 93 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 BVESQ8NE79 360 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 GPHA2Q96T91 129 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZFHX3Q15911 3703 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PPI3 338 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 S100GP29377 79 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 MOB3BQ86TA1 216 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 OR8H3Q8N146 312 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 SLC2A9Q9NRM0 540 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 GPR132Q9UNW8 380 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 VSIG4Q9Y279 399 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 NABP2Q9BQ15 211 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 COPZ2Q9P299 210 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 FN1P02751 2386 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 TIMM23O14925 209 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 RLN1P04808 185 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 CT45A6P0DMU7 189 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 CT45A5P0DMU8 189 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 CT45A7P0DMV0 189 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 DUTP33316 252 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 PIGPP57054 158 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00205P59089 165 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 KCTD9Q7L273 389 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 NRARPQ7Z6K4 114 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 TMED4Q7Z7H5 227 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 TCRBP04435 133 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 THBS3P49746 956 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF66Q6ZN08 573 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXA4-202ENST00000428284 OR51H1Q8NH63 302 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms