RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 CBX3Q13185 183 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF152Q8N8N0 203 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 GINS4Q9BRT9 223 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0B4J203 849 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 H0YJW9 148 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RRHO14718 337 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 BET1O15155 118 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SPDEFO95238 335 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHG4P01861 327 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 GSTT2P0CG29 244 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 GSTT2BP0CG30 244 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CD33P20138 364 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CBX5P45973 191 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 GNG2P59768 71 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MXD1Q05195 221 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PLA2G7Q13093 441 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IDNKQ5T6J7 187 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CNIH2Q6PI25 160 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 REC114Q7Z4M0 266 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF329Q86UD4 541 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PDPNQ86YL7 162 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF695Q8IW36 515 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CYYR1Q96J86 154 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR51J1Q9H342 316 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF150Q9ULK6 438 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA2Q9UM82 520 aa6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TNCP24821 2201 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PRX2 142 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM30A4D0T7 59 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 NUDT19A8MXV4 375 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8U9P0C7N5 309 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MYCNOSP40205 109 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 THBS3P49746 956 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PLGLAQ15195 96 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RTL8BQ17RB0 113 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IGSF11Q5DX21 431 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM65Q6PI78 240 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8U1Q8NH10 309 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 YIPF6Q96EC8 236 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.69□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM235A6NFC5 223 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01548A6NM66 108 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 M0R1X1 148 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 XRCC3O43542 346 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PROP1O75360 226 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CD40LGP29965 261 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CFHR3Q02985 330 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RITA1Q96K30 269 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM68Q96MH6 324 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CMTM3Q96MX0 182 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2D2Q9H210 308 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.68□□□□□ -1.34
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