RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CDK10Q15131 360 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CTAGE6Q86UF2 777 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC22A24Q8N4F4 322 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CHID1Q9BWS9 393 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 VAPAQ9P0L0 249 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DNAJC12Q9UKB3 198 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C19orf84I3L1E1 186 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RFXANKO14593 260 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UBDO15205 165 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GMDSO60547 372 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 STK16O75716 305 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SNX4O95219 450 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DEFA4P12838 97 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AKR1C4P17516 323 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TUBG1P23258 451 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CD79BP40259 229 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR1E2P47887 323 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ASCL4Q6XD76 172 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C1orf158Q8N1D5 194 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM75Q8N9X5 138 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR51L1Q8NGJ5 315 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCDC127Q96BQ5 260 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ANKHQ9HCJ1 492 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TUBG2Q9NRH3 451 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TNXBP22105 4242 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SULT1A2P50226 295 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ETV1P50549 477 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 STC1P52823 247 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00313P59037 77 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DAOAP59103 153 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DSTNP60981 165 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CENPWQ5EE01 88 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ACTL10Q5JWF8 245 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HBMQ6B0K9 141 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SCGB1D4Q6XE38 83 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ARHGAP18Q8N392 663 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CDKL2Q92772 493 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ABHD14BQ96IU4 210 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AMELYQ99218 206 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR51E2Q9H255 320 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NDUFB2O95178 105 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PSMG1O95456 288 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GADD45AP24522 165 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DAPP51397 102 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TBC1D28Q2M2D7 210 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CCDC112Q8NEF3 446 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SERPINI1Q99574 410 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BLZF1Q9H2G9 400 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM216Q9P0N5 145 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SMARCA4P51532 1647 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NSD2O96028 1365 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ABCA4P78363 2273 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A0D9SG42 100 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H7C2G1 150 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGLV3-27P01718 113 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EMP1P54849 157 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TSPAN5P62079 268 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BEX3Q00994 111 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GNA12Q03113 381 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLCZ1Q86YW0 608 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AQP3Q92482 292 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PGLYRP3Q96LB9 341 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TAS2R13Q9NYV9 303 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IFNKQ9P0W0 207 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00527Q9UJ94 153 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PTPRSQ13332 1948 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NEURL4Q96JN8 1562 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MEIS3P1A6NDR6 274 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MGAT4DA6NG13 374 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ITGB1BP1O14713 200 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AKR7A2O43488 359 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms