RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N6K4 173 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SETD6Q8TBK2 473 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 A0A075B6Q4 140 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0B4J203 849 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC160A6NGH7 325 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 LANCL1O43813 399 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 YPEL1O60688 119 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 MOSP00540 346 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 IGHG2P01859 326 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FCGR3AP08637 254 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 LSAMPQ13449 338 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 MORN2Q502X0 79 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF329Q86UD4 541 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ISOC1Q96CN7 298 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 YPEL2Q96QA6 119 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 S1PR3Q99500 378 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 Q9N2K0 584 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FABP7O15540 132 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A5O76082 557 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 GPR12P47775 334 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35B1P78383 322 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZPA2 131 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 STPG2Q8N412 459 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N9W7 124 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 GINS4Q9BRT9 223 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.05□□□□□ -1.44
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM235A6NFC5 223 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FAM25AB3EWG3 89 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FAM25CB3EWG5 89 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 FAM25GB3EWG6 89 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 H3BMQ9 156 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 AP4M1O00189 453 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SULT1C2O00338 296 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RAB29O14966 203 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RGS5O15539 181 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS3P35030 304 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM6P40199 344 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR3A3P47888 321 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 F2RL1P55085 397 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R46P59540 309 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ARPC4P59998 168 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G7Q13093 441 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 MMDQ15546 238 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CNIH2Q6PI25 160 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 BORCS5Q969J3 196 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 IFT46Q9NQC8 304 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF221Q9UK13 617 aa6.04□□□□□ -1.44
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