RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 KLK11Q9UBX7 282 aa21.44■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 MTFP1Q9UDX5 166 aa21.44■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 OR2F2O95006 317 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 NDUFA7O95182 113 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV1D-33P01593 117 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV1-33P01594 117 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 PMP2P02689 132 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 HLA-DMAP28067 261 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 LSAMPQ13449 338 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 DYRK1AQ13627 763 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 DHRS11Q6UWP2 260 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 EHFQ9NZC4 300 aa21.43■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 CHST1O43916 411 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 PROP1O75360 226 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 MOSP00540 346 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 CT45A6P0DMU7 189 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 CT45A5P0DMU8 189 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 CT45A7P0DMV0 189 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM11P17152 192 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 MC5RP33032 325 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 RFX2P48378 723 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 FAM131AQ6UXB0 335 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 SLC25A33Q9BSK2 321 aa21.42■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 HRH1P35367 487 aa21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 ACTBL2Q562R1 376 aa21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF645Q8N7E2 425 aa21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 OR4F5Q8NH21 305 aa21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 SMIM4Q8WVI0 70 aa21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 SDHAF2Q9NX18 166 aa21.41■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 J3QRK9 145 aa21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 M0QZK8 103 aa21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN9O75954 239 aa21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 PPYP01298 95 aa21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 RAG2P55895 527 aa21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 DGCR2P98153 550 aa21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 HNF4GQ14541 408 aa21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GUS0 222 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 OR5H14A6NHG9 310 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 M0R1X1 148 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 AADACP22760 399 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 RELBQ01201 579 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC190Q86UF4 302 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 OR5AN1Q8NGI8 311 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 OR4C13Q8NGP0 309 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 OR6F1Q8NGZ6 308 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 C16orf95Q9H693 158 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 BEX1Q9HBH7 125 aa21.39■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TBPP20226 339 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN5P62079 268 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 SPANXN2Q5MJ10 180 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 Q6ZSV7 163 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 OR8H1Q8NGG4 311 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 PRSS22Q9GZN4 317 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R8Q9NYW2 309 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 MOB4Q9Y3A3 225 aa21.38■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV1-13P0DP09 117 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 COMPP49747 757 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R19P59542 299 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 MSMO1Q15800 293 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 Q8N6K4 173 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM229BQ8NBD8 167 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 ADTRPQ96IZ2 230 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 MMP24Q9Y5R2 645 aa21.37■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 ETV6P41212 452 aa21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 HERV-K104P61576 105 aa21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 FBLN7Q53RD9 439 aa21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 VAX1Q5SQQ9 334 aa21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 WASHC3Q9Y3C0 194 aa21.36■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 H0YJW9 148 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 FGF16O43320 207 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 APOA2P02652 100 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 IFNA6P05013 189 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 CSF1P09603 554 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 THBS3P49746 956 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 PYDC2Q56P42 97 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM17Q86X19 198 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF383Q8NA42 475 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB34Q8NCN2 500 aa21.35■■□□□ 1.01
CRIP1-201ENST00000330233 SECTM1Q8WVN6 248 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms