RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ALPK3Q96L96 1907 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GDF9O60383 454 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 MYOGP15173 224 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF56Q15929 161 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 MS4A8Q9BY19 250 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 MVDP53602 400 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GFRA1P56159 465 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ASB1Q9Y576 335 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TNXAQ16473 311 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SOSTQ9BQB4 213 aa9.83□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 CDKN3Q16667 212 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR54Q9H977 334 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 CD22P20273 847 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HOXA5P20719 270 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OR3A4PP47883 348 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GUCA2BQ16661 112 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 H3BUT2 72 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM258P61165 79 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ATXN8Q156A1 80 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 AMER3Q8N944 861 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HMGN4O00479 90 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 KLK2P20151 261 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 EDIL3O43854 480 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 MPZL1O95297 269 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR183P32249 361 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LPAL2Q16609 132 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PSMG4Q5JS54 123 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM157AC9JC47 383 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FAHD1Q6P587 224 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SPINK8P0C7L1 97 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR82Q96P67 336 aa9.82□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TRACP01848 142 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GLIPR1P48060 266 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FZR1Q9UM11 496 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 DUSP2Q05923 314 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FGF5P12034 268 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 P2RY4P51582 365 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LAT2Q9GZY6 243 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 NDUFB4O95168 129 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 IFITM2Q01629 132 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PR80 420 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 C7orf66A4D0T2 115 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 C16orf92Q96LL3 132 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00587B1AMM8 73 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ATP5LO75964 103 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FXYD1O00168 92 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 VDAC1P21796 283 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GNG3P63215 75 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 C10orf111Q8N326 155 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBP1Q9H171 429 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 RABAC1Q9UI14 185 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR146Q96CH1 333 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PLPP1O14494 284 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 GPX2P18283 190 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 LIM2P55344 173 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SVIPQ8NHG7 77 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 NT5CQ8TCD5 201 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.8□□□□□ -0.84
HDGFL3-201ENST00000299633 PNKDQ8N490 385 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms