RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	HAND1	O96004	215 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CELA3B	P08861	270 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF90	Q03938	601 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		Q8WTZ3	238 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		M0R1B8	84 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TRGC1	P0CF51	173 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	OR7C2	O60412	319 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC29	Q8WV35	223 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1B0GU03	582 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZG16	O60844	167 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	IRF2	P14316	349 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CTSS	P25774	331 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	CFP	P27918	469 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	LINC00205	P59089	165 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	HES3	Q5TGS1	186 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		H0Y980	276 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A087X0M5	115 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1B0GX30	115 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	DNPH1	O43598	174 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	G0S2	P27469	103 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	IL22RA2	Q969J5	263 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	S1PR3	Q99500	378 aa		10.02	□□□□□ -0.8
SPIN3-223	ENST00000639525	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	CA11	O75493	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	CXCL1	P09341	107 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	HIST3H3	Q16695	136 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	TRANK1	O15050	2925 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525		A8MXE2	369 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525		K7N7A8	449 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	SSTR5	P35346	364 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	THBS3	P49746	956 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35B1	P78383	322 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	GGN	Q86UU5	652 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	NTF3	P20783	257 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	UHRF2	Q96PU4	802 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	COA4	Q9NYJ1	87 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	S1PR2	O95136	353 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	HBZ	P02008	142 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	GLIPR1	P48060	266 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	UCP3	P55916	312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	TCL1A	P56279	114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525		Q0VFX4	171 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	GAMT	Q14353	236 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR87	Q9BY21	358 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525		F6UZH7	168 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	UCP1	P25874	307 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SPIN3-223	ENST00000639525	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81

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