RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 AGMATQ9BSE5 352 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PECRQ9BY49 303 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 AK3Q9UIJ7 227 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 GAB2Q9UQC2 676 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 MFNGO00587 321 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 SCGNO76038 276 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 IGHG4P01861 327 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 PF4P02776 101 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CD33P20138 364 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 RAB3BP20337 219 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 GADD45AP24522 165 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 MYCNOSP40205 109 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 VEGFCP49767 419 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 HNF4GQ14541 408 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 KIR2DS1Q14954 304 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ZNF773Q6PK81 442 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 SPARTQ8N0X7 666 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 STUB1Q9UNE7 303 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 SHISA3A0PJX4 238 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 TRDCB7Z8K6 153 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 RAB27BO00194 218 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 NBR2O15453 112 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 SPDEFO95238 335 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 PSMB8P28062 276 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 THBS3P49746 956 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 F2RL1P55085 397 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ACTBP60709 375 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 MMDQ15546 238 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 RAB3CQ96E17 227 aa7.13□□□□□ -1.27
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PKP4-218ENST00000629219 P2RX4Q99571 388 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 KCNK15Q9H427 330 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 COL7A1Q02388 2944 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 NOTOA8MTQ0 251 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 H0YJW9 148 aa7.12□□□□□ -1.27
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PKP4-218ENST00000629219 CT45A6P0DMU7 189 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CT45A5P0DMU8 189 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CT45A7P0DMV0 189 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 VDAC1P21796 283 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 DTYMKP23919 212 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CLDN12P56749 244 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 OR10A3P58181 314 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 RUNX1Q01196 453 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ZNF329Q86UD4 541 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 PDPNQ86YL7 162 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ZNF695Q8IW36 515 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 CYYR1Q96J86 154 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 KIAA1456Q9P272 454 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 A0A0A6YYH2 397 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PRX2 142 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 A6NJ64 397 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 RRHO14718 337 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-218ENST00000629219 ST8SIA5O15466 376 aa7.11□□□□□ -1.27
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