RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LINC00596Q86U02 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ST8SIA2Q92186 375 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 DYRK2Q92630 601 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SLAMF9Q96A28 289 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 C2orf50Q96LR7 162 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RHOFQ9HBH0 211 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MBD2Q9UBB5 411 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 H0YIZ8 118 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NAPSAO96009 420 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 KNG1P01042 644 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LIPFP07098 398 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF728P0DKX0 622 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PRDX2P32119 198 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PAX2Q02962 417 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PDCD1Q15116 288 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 AANATQ16613 207 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 TOR2AQ5JU69 321 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF561Q8N587 486 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MOB3AQ96BX8 217 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 GALNT14Q96FL9 552 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SDSLQ96GA7 329 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 OR10C1Q96KK4 312 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 GAFA1Q96PS6 74 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MMP26Q9NRE1 261 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PRR13Q9NZ81 148 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MPTX1A8MV57 137 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SHOXO15266 292 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SPDEFO95238 335 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RLN2P04090 185 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 GLAP06280 429 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 FCGR2CP31995 323 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PAX8Q06710 450 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 IL13RA2Q14627 380 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 BATF2Q8N1L9 274 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LRTM2Q8N967 370 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NAA60Q9H7X0 242 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 IFT22Q9H7X7 185 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 Q9N2K0 584 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 GLS2Q9UI32 602 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 A0A1B0GW55 424 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 C22orf46C9J442 243 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 FCN3O75636 299 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 PRKACAP17612 351 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 GLP1RP43220 463 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 PIGPP57054 158 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 RIPPLY3P57055 190 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM187Q14656 261 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF146Q15072 292 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 CD177Q8N6Q3 437 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 OR1S1Q8NH92 325 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 STOML3Q8TAV4 291 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 DCUN1D4Q92564 292 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 CXorf58Q96LI9 332 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD4-217ENST00000611848 AQP10Q96PS8 301 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms