RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.19■□□□□ 0.02
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SGMS1-208ENST00000608287 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.19■□□□□ 0.02
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SGMS1-208ENST00000608287 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.19■□□□□ 0.02
SGMS1-208ENST00000608287 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.19■□□□□ 0.02
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SGMS1-208ENST00000608287 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SGMS1-208ENST00000608287 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.12■□□□□ 0.01
SGMS1-208ENST00000608287 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SGMS1-208ENST00000608287 ITGB1BP1O14713 200 aa15.11■□□□□ 0.01
SGMS1-208ENST00000608287 FABP7O15540 132 aa15.11■□□□□ 0.01
SGMS1-208ENST00000608287 IGHG2P01859 326 aa15.11■□□□□ 0.01
SGMS1-208ENST00000608287 F2RL1P55085 397 aa15.11■□□□□ 0.01
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