RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592848.5

BCAS3-231, Transcript of BCAS3, microtubule associated cell migration factor, human

TSL 5

Gene BCAS3, Length 918 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAS3-231	ENST00000592848	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BCAS3-231	ENST00000592848	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BCAS3-231	ENST00000592848	EHF	Q9NZC4	300 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BCAS3-231	ENST00000592848	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		7.4	□□□□□ -1.22
BCAS3-231	ENST00000592848	ATR	Q13535	2644 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848		A6NHS1	94 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	CTDSPL	O15194	276 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	SLC31A2	O15432	143 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	IGHV4-59	P01825	116 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	IFNA6	P05013	189 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	FAM106CP	P0CH98	169 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	OR5H8	P0DN80	308 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	IER3	P46695	156 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	INPP1	P49441	399 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	RAB13	P51153	203 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	AP3S2	P59780	193 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	HERPUD1	Q15011	391 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	PYDC2	Q56P42	97 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	MOB3B	Q86TA1	216 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	OR52I2	Q8NH67	350 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	SNAPC3	Q92966	411 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		7.39	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848		A0A1W2PPI3	338 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	LY6L	H3BQJ8	138 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TIMM23	O14925	209 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	APOA2	P02652	100 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	FCER2	P06734	321 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	OR8U9	P0C7N5	309 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	NAT1	P18440	290 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	HLA-DMA	P28067	261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	S100G	P29377	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	FCGR2C	P31995	323 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	HRH1	P35367	487 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	REG1B	P48304	166 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TAS2R19	P59542	299 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TSPAN5	P62079	268 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	HES1	Q14469	280 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	MEF2D	Q14814	521 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	OR8U1	Q8NH10	309 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	OR56B4	Q8NH76	319 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	C17orf50	Q8WW18	174 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	DUX5	Q96PT3	197 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ABHD1	Q96SE0	405 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TCF19	Q9Y242	345 aa		7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	OR5H14	A6NHG9	310 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848		M0QZK8	103 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848		M0R1X1	148 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	GPR137B	O60478	399 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	VENTX	O95231	258 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	PPY	P01298	95 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	PMP2	P02689	132 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TMEM11	P17152	192 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ZNF134	P52741	427 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	FXYD4	P59646	89 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	DGCR2	P98153	550 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	LSAMP	Q13449	338 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	DYRK1A	Q13627	763 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	LY6E	Q16553	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	UTF1	Q5T230	341 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	TRIQK	Q629K1	86 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	CCDC190	Q86UF4	302 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	DRAM1	Q8N682	238 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		7.37	□□□□□ -1.23
BCAS3-231	ENST00000592848	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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