RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	P2RY14	Q15391	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RAB11B	Q15907	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	PRR25	Q96S07	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	GFI1	Q99684	422 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RAB29	O14966	203 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SOCS1	O15524	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	IGF1	P05019	195 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	MAP2K4	P45985	399 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	FABP5	Q01469	135 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	P2RX4	Q99571	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578		V9GY05	133 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CCL24	O00175	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	NBR2	O15453	112 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	JTB	O76095	146 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZBTB25	P24278	435 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	OR3A3	P47888	321 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	VEGFC	P49767	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CFHR3	Q02985	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	HSPA12A	O43301	675 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	LY86	O95711	162 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	IGHG4	P01861	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	CLDN12	P56749	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	LIN54	Q6MZP7	749 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	LYST	Q99698	3801 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578		Q9N2K0	584 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	PDCD5	O14737	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	CNTFR	P26992	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	MC5R	P33032	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	CEACAM6	P40199	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM50B	P56557	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	NPB	Q8NG41	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	RITA1	Q96K30	269 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME3-215	ENST00000592578	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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