RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 LTC4SQ16873 150 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 Q3ZCU0 254 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF695Q8IW36 515 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35G3Q8N808 338 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SDHAF2Q9NX18 166 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ST8SIA5O15466 376 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 OMGP23515 440 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 EFNA4P52798 201 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 DLX6P56179 175 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IFITM2Q01629 132 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 HEPN1Q6WQI6 88 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF714Q96N38 554 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GON7Q9BXV9 100 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IFI27L2Q9H2X8 130 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RPA2P15927 270 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL2P19875 107 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CDKN1AP38936 164 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF134P52741 427 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 AVPI1Q5T686 147 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 OR51H1Q8NH63 302 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIHO43447 177 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 LY6HO94772 140 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 VDAC1P21796 283 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CATR1Q13166 79 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF585BQ52M93 769 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 NMSQ5H8A3 153 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CT45A1Q5HYN5 189 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CT45A3Q8NHU0 189 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 C8orf46Q8TAG6 207 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 THAP6Q8TBB0 222 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD14BQ96IU4 210 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF126Q9BV68 326 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SLA2Q9H6Q3 261 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 BAHCC1Q9P281 2608 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 F5H0A9 414 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS13O14921 159 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP23AO75900 390 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINE2P07093 398 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 C4BPBP20851 252 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR12P47775 334 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL30P62888 115 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS54Q6PEW0 395 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF546Q86UE3 836 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 C8orf31Q8N9H6 132 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8B3Q8NGG8 313 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8B2Q96RD0 313 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SPIN2AQ99865 258 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFSF18Q9UNG2 199 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC31A2O15432 143 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PROP1O75360 226 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A6P12236 298 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL3L1P16619 93 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 UTF1Q5T230 341 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB39BQ96DA2 213 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFP57Q9NU63 452 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GSKIPQ9P0R6 139 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF462Q96JM2 2506 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087X0M5 115 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GX30 115 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf98A8MV24 154 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 H0YIZ8 118 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 L7N2F9 121 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ARPC5O15511 151 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN1O95832 211 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1-39P01597 117 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1D-39P04432 117 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PET100P0DJ07 73 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB32Q13637 225 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4D5Q8NGN0 318 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF596Q8TC21 504 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD2Q9UBB5 411 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-207ENST00000589146 NFYBP25208 207 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-207ENST00000589146 DUTP33316 252 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF345Q14585 488 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-207ENST00000589146 LY6G5BQ8NDX9 201 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-207ENST00000589146 MFFQ9GZY8 342 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0D9SG52 128 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB29O14966 203 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms