RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	CA2	P00918	260 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CSN3	P07498	182 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477		Q8N402	240 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	BANF2	Q9H503	90 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477		A0A0G2JLM5	398 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CD81	P60033	236 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	RIPK1	Q13546	671 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GALM	Q96C23	342 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.59	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FCGR1A	P12314	374 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FUT3	P21217	361 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	MC5R	P33032	325 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	PSG5	Q15238	335 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	POC5	Q8NA72	575 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	MUL1	Q969V5	352 aa		11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477		H0YJW9	148 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	RAB29	O14966	203 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	TPPP	O94811	219 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	BAG2	O95816	211 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FST	P19883	344 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	DEFA5	Q01523	94 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FXYD3	Q14802	87 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	DEFB125	Q8N687	156 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	DDB2	Q92466	427 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	NEURL2	Q9BR09	285 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.57	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477		H3BUA1	57 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	SLC22A1	O15245	554 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	RBBP9	O75884	186 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CNIH1	O95406	144 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	TRBV12-3	P01733	135 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	GLA	P06280	429 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CD7	P09564	240 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	MGMT	P16455	207 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	GABRB1	P18505	474 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	KMT2A	Q03164	3969 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	RNF5	Q99942	180 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.56	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	HERC2	O95714	4834 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	GPX5	O75715	221 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ALPL	P05186	524 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	LIMS3	P0CW19	117 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	LIMS4	P0CW20	117 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	HMGN3	Q15651	99 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	GHSR	Q92847	366 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477		Q96M66	194 aa		11.55	□□□□□ -0.56
IFT20-216	ENST00000588477	OR14A2	Q96R54	314 aa		11.55	□□□□□ -0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms