RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.54□□□□□ -0.08
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HERC2-208ENST00000566635 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.54□□□□□ -0.08
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HERC2-208ENST00000566635 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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HERC2-208ENST00000566635 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.53□□□□□ -0.08
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HERC2-208ENST00000566635 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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HERC2-208ENST00000566635 KRTAP10-9P60411 292 aa14.52□□□□□ -0.09
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HERC2-208ENST00000566635 ZNF787Q6DD87 383 aa14.52□□□□□ -0.09
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HERC2-208ENST00000566635 PERPQ96FX8 193 aa14.52□□□□□ -0.09
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HERC2-208ENST00000566635 H0Y980 276 aa14.51□□□□□ -0.09
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HERC2-208ENST00000566635 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.51□□□□□ -0.09
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HERC2-208ENST00000566635 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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HERC2-208ENST00000566635 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC2-208ENST00000566635 C17orf98A8MV24 154 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC2-208ENST00000566635 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HERC2-208ENST00000566635 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC2-208ENST00000566635 DNASE1P24855 282 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC2-208ENST00000566635 GZMKP49863 264 aa14.49□□□□□ -0.09
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