RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 BORCS5Q969J3 196 aa7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 RPEQ96AT9 228 aa7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 S1PR3Q99500 378 aa7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 MCUBQ9NWR8 336 aa7.16□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 LY6LH3BQJ8 138 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 SLC31A2O15432 143 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 CRLF1O75462 422 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 TUSC2O75896 110 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 PPYP01298 95 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 FBP1P09467 338 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 BRS3P32247 399 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 GPR12P47775 334 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 FXYD4P59646 89 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 PLA1AQ53H76 456 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 TERB2Q8NHR7 220 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 TRIM63Q969Q1 353 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 SLC6A7Q99884 636 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 PRRT1Q99946 306 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 AGMATQ9BSE5 352 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.15□□□□□ -1.26
APH1B-210ENST00000560890 MED13LQ71F56 2210 aa7.15□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 CREBBPQ92793 2442 aa7.15□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 A0A0U1RQK1 487 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 TXNL1O43396 289 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNF735P0CB33 412 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 FAM157CP0CG43 387 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 S100GP29377 79 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ECI1P42126 302 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNF137PP52743 207 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 UCP3P55916 312 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 CENPEQ02224 2701 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 MOB3BQ86TA1 216 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 OR8H3Q8N146 312 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 OR56B4Q8NH76 319 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 TOMM40LQ969M1 308 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 MOB3AQ96BX8 217 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 OR2D2Q9H210 308 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.14□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 HSD17B6O14756 317 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 UPK1BO75841 260 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 PGAM2P15259 253 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 MC5RP33032 325 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 REG1BP48304 166 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 MSMO1Q15800 293 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 C16orf87Q6PH81 154 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 SSX3Q99909 188 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 ITPR2Q14571 2701 aa7.13□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.12□□□□□ -1.27
APH1B-210ENST00000560890 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms