RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 RNF150Q9ULK6 438 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM235A6NFC5 223 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TRDCB7Z8K6 153 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 AIREO43918 545 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 IGLV2-14P01704 120 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM106CPP0CH98 169 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CD1BP29016 333 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CEACAM6P40199 344 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 VBP1P61758 197 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 IDNKQ5T6J7 187 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 ITGB1BP1O14713 200 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM11P17152 192 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CD83Q01151 205 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 Q6ZS49 121 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF383Q8NA42 475 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 MMP27Q9H306 513 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 RDH8Q9NYR8 311 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTA-207ENST00000558936 M0QZK8 103 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FABP7O15540 132 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHG2P01859 326 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 IL3RAP26951 378 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 CFHR3Q02985 330 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 HES1Q14469 280 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 HACD4Q5VWC8 232 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 S1PR3Q99500 378 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 SPATA2Q9UM82 520 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 TNCP24821 2201 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 SERPINE3A8MV23 424 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 H0YJW9 148 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FCN1O00602 326 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FGF16O43320 207 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXO24O75426 580 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 GABARAPO95166 117 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 NDPQ00604 133 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF329Q86UD4 541 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 SNAPC3Q92966 411 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 ABCG5Q9H222 651 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 TXNL1O43396 289 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 MOSP00540 346 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 IGKV1-16P04430 117 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FCER2P06734 321 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 CSF1P09603 554 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 ZBTB25P24278 435 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 RANBP1P43487 201 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 NOTCH1P46531 2555 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00473A8K010 186 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 BET1O15155 118 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 KCNAB3O43448 404 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTA-207ENST00000558936 PEX14O75381 377 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms