RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552548.5

PFDN5-217, Transcript of prefoldin subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene PFDN5, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5-217ENST00000552548 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.7□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 A0A0B4J293 547 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 A0A1W2PPI3 338 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 M0R1X1 148 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 GPR37O15354 613 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 HSPA12AO43301 675 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 YPEL1O60688 119 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 RAMP3O60896 148 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 SCGNO76038 276 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 IGHV4-59P01825 116 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 EPHA1P21709 976 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 CD34P28906 385 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 HTD2P86397 168 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 PITPNAQ00169 270 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 SP6Q3SY56 376 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TRIQKQ629K1 86 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TMEM219Q86XT9 240 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 OR9G1Q8NH87 305 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 CFHR4Q92496 578 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 YPEL2Q96QA6 119 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 GINS4Q9BRT9 223 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 JPT1Q9UK76 154 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.69□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 CREBBPQ92793 2442 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.56e-7■□□□□ 9
PFDN5-217ENST00000552548 A0A1B0GVG6 124 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 FUOMA2VDF0 154 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 LINC01548A6NM66 108 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TIMM23O14925 209 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 LYRM1O43325 122 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 CHST1O43916 411 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 IGKV1-39P01597 117 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 IGKV1-16P04430 117 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 IGKV1D-39P04432 117 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 AKAIN1P0CW23 69 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 ZBTB25P24278 435 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 KIR2DS4P43632 304 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 CBX5P45973 191 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 UBE2E1P51965 193 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 F2RL1P55085 397 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TAS2R19P59542 299 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TSPAN5P62079 268 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 KIR2DS1Q14954 304 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 FAM189A2Q15884 450 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 ZNF596Q8TC21 504 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 MOB3AQ96BX8 217 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 NABP2Q9BQ15 211 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TOLLIPQ9H0E2 274 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.68□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 A0A0G2JRQ6 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TOR1AO14656 332 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 VENTXO95231 258 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 RLN1P04808 185 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 CSF1P09603 554 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 PGAM2P15259 253 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 ZNF585BQ52M93 769 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 LIN54Q6MZP7 749 aa5.67□□□□□ -1.5
PFDN5-217ENST00000552548 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.67□□□□□ -1.5
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