RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 IGSF23A1L1A6 192 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 MMP15P51511 669 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 I3L521 148 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 FFAR1O14842 300 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM11O75078 769 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 ATG101Q9BSB4 218 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 H7BYZ3 331 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 RD3LP0DJH9 198 aa6.85□□□□□ -1.31
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